กลุ่มงานฯ มีการควบคุมคุณภาพภายใน ในแต่ละชุดตัวอย่างจะครอบคลุมวิธีการต่างๆตามความเหมาะสมได้แก่ การใช้ตัวอย่างควบคุม (Control Sample) การควบคุมค่า Blank ต่างๆ (Reagent blank, Method blank) การทดสอบซ้ำ การควบคุมค่ากลับคืน (% Recovery) การใช้วัสดุอ้างอิงรับรองเป็นประจำ การควบคุม Calibration curve ของสารมาตรฐานที่เกี่ยวข้อง การควบคุมการใช้เครื่องมือโดยใช้ Parameter ที่เหมาะสม เป็นต้น  นอกจากนี้แล้วกลุ่มงานฯ พิจารณาเลือกโปรแกรมการทดสอบความชำนาญ (Proficiency Testing) หรือเปรียบเทียบผลการทดสอบระหว่างห้องปฏิบัติการ (Inter-laboratory Comparison) ที่เหมาะสมกับกิจกรรมทดสอบของห้องปฏิบัติการ หรือกิจกรรมอื่นๆ ที่เหมาะสม เช่นการประเมินความถูกต้องโดยใช้วัสดุอ้างอิงรับรอง  ทั้งนี้ต้องพิจารณาถึงประเภทของตัวอย่าง  ระดับความเข้มข้นของสิ่งที่ต้องการตรวจวัด และการประเมินผลทางสถิติด้วย

ปีงบประมาณ 2552 : กิจกรรมการเข้าร่วมกิจกรรมทดสอบความชำนาญกับกรมวิทยาศาสตร์
1. รายการ Heavy metals (Cr, Cu, Fe, Cd, Zn) in water
2. รายการ Suspended solids (SS) in water
3. รายการ Total dissolved solids (TDS) in water
4. รายการ pH-value  

5. รายการ Chemical Oxygen Demand (COD) in water

          เพื่อให้ผลการวิเคราะห์/ทดสอบของกลุ่มงานวิเคราะห์คุณภาพสิ่งแวดล้อมมีความถูกต้องแม่นยำ  ทางกลุ่มงานวิเคราะห์คุณภาพสิ่งแวดล้อมได้มีการควบคุมคุณภาพภายในของแต่ละชุดตัวอย่าง ซึ่งการควบคุมคุณภาพภายในจะครอบคลุมวิธีการต่างๆตามความเหมาะสม เช่น

1. การใช้ตัวอย่างควบคุม (Control Sample)
2. การควบคุมค่า Blank ต่างๆ (Reagent blank, Method blank)
3. การทดสอบซ้ำ
4. การควบคุมค่ากลับคืน (% Recovery)
5. การใช้วัสดุอ้างอิงรับรองเป็นประจำ
6. การควบคุม Calibration curve ของสารมาตรฐานที่เกี่ยวข้อง
7. การควบคุมการใช้เครื่องมือ
8. การประเมินความถูกต้องโดยใช้วัสดุอ้างอิงรับรอง  ทั้งนี้ต้องพิจารณาถึงประเภทของตัวอย่าง  ระดับความเข้มข้นของสิ่งที่ต้องการตรวจวัด และการประเมินผลทางสถิติด้วย

          นอกจากนี้แล้วกลุ่มงานวิเคราะห์คุณภาพสิ่งแวดล้อมได้พิจารณาเลือกโปรแกรมการทดสอบความชำนาญ (Proficiency Testing) หรือเปรียบเทียบผลการทดสอบระหว่างห้องปฏิบัติการ (Inter-laboratory Comparison) ที่เหมาะสมกับกิจกรรมทดสอบของห้องปฏิบัติการ
โดยในปีงบประมาณ 2553 กลุ่มงานวิเคราะห์คุณภาพสิ่งแวดล้อมได้เข้าร่วมกิจกรรมทดสอบความชำนาญกับกรมวิทยาศาสตร์ จำนวน 6 รายการ ซึ่งผลการทดสอบผ่านทุกรายการ ดังนี้

1. รายการ Heavy metals (Cr, Cu, Fe, Cd, Zn) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 10 mg/L
2. รายการ Total Hardness (as CaCO3) and Chloride (as Cl) ช่วงความเข้มข้น 75-130 mg/L และ 10-50 mg/L
3. รายการ pH-value  ช่วง pH 4.0-7.0 และ 8.0-10
4. รายการ Total dissolved solids (TDS) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 500 mg/L
5. รายการ Suspended solids (SS) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 200 mg/L
6. รายการ Chemical Oxygen Demand (COD) in water ช่วงความเข้มข้น 50-200 และ 400-600 mg/L

 
และในปีงบประมาณ 2554 ได้สมัครเข้าร่วมกิจกรรมทดสอบความชำนาญกับกรมวิทยาศาสตร์ จำนวน 5 รายการ ดังนี้

1. รายการ Heavy metals (Cr, Cu, Fe, Cd, Zn) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 5 mg/L
2. รายการ Total Hardness (as CaCO3) and Chloride (as Cl) ช่วงความเข้มข้น 50-300 mg/L
3. รายการ Total dissolved solids (TDS) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 500 mg/L
4. รายการ Suspended solids (SS) in water   ช่วงความเข้มข้นน้อยกว่า 200 mg/L
5.  รายการ Chemical Oxygen Demand (COD) in water  ช่วงความเข้มข้น 50-200 และ 400-600 mg/L